Михаела Зелингер је каријеру започела 2004. године у аустријским оперским кућама Клагенфурта, Корушке и Инзбрука. Од 2005–2010. била је члан Бечке државне опере. Од тада је развила међународну каријеру као оперски и концертни солиста, укључујући позиве за Фестивалску оперу у Глајндборну, минхенску Државну оперу, Оперу на Рајни, Оперу из Лиона, Ново национално позориште из Токија, бечки Музикферајн, бечки Концертхаус, Чикашки симфонијски оркестар и Салцбуршки фестивал. Њене најзапаженије оперске улоге су Октавијан у Каваљеру с ружом, Композитор у Аријадни на Наксосу, Керубино у Фигаровој женидби и Идаманте у Идоменеју. Последњих сезона Михаела Зелингер гостовала је у Театро дел Опера у Риму, где је певала Керубина у Фигаровој женидби под вођством Рикарда Мутија. За Лајпцишку оперу наступила је у улози Композитора у Аријадни на Наксосу, а у бечком Музикферајну је наступила у Бетовеновој Симфонији бр. 9 под вођством Жоржа Претра. Певала је улогу Идаманте у новој продукцији Идоменео у Театру Алто у Есену, и Моцартову Мису у ц-молу и Реквијем са Камератом академика Салцбург под вођством Луја Лангреа и Жозепа Кабалеа Доменека. Певала је Соњетку у продукцији Дмитрија Черњакова из 2016. Леди Магбет Мценског округа и Хану Арент у Бењамину, Последњој ноћи Мишела Табачника у Лионској опери. Позвана је у Националну оперу у Варшави да пева улогу Брангене у Тристану и Изолди, а вратила се на Салцбуршки фестивал за Штраусову Данајину љубав. На Академији Санта Ћећилија у Риму певала је у Штраусовој опери Шишмиш и репризирала ту улогу у минхенској Државној опери. Раније овог месеца дебитовала је као Валтрауте у Валкири у Немачкој опери у Берлину, а прошлог месеца отпевала је Бергових Седам раних песама са Државну оперу из Брауншвајга под управом Штефаном Шолтесом. Михаела се први пут појавила у Великој Британији у опери Фестивала у Глајндборну 2011. године, као Магдалена у Вагнеровом Мајсторима певачима из Нирнберга.