У својој истакнутој каријери, виолончелиста Јан Фоглер остварио је успешне сарадње са многим реномираним диригентима и међународно признатим оркестрима широм света, као што су Њујоршка филхармонија, Оркестар Гевандхаус из Лајпцига, Немачки симфонијски оркестар из Берлина и Лондонска филхармонија. Његов изузетан таленат му је омогућио да истражује изражајне могућности виолончела и успостави присан дијалог са савременим композиторима и уметницима. То подразумева редовне светске премијере дела Тиграна Мансуријана (са Симфонијским оркестром Радија Југозападне Немачке под вођством Семјона Бичкова), Џона Харбисона (са Миром Ванг и Симфонијским оркестром из Бостона), Уда Цимермана (Симфонијски оркестар Баварског радија), Волфганга Рима (Двоструки концерт са Миром Ванг), Јорга Видмана (Концерт за виолончело Тамне жице, посвећен управо Јану Фоглеру), Никоа Мјулија, Свена Хелбига и Жу-Лонга (Концерт за виолончело и оркестар Три континента, компонован за Јана Фоглера) и Шона Шеперда (На ведар дан – композиција заснована на циклусу песама Уле Хан, за виолончело, хорове и оркестар, премијерно изведена 2023. године са Државном  филхармонијом из Хамбурга под диригентском палицом Кента Нагана). Њујорк тајмс велича његово осећајно свирање богатог тона, а Франкфуртер Алгемајне Цајтунг му приписује способност да под његовим прстима виолончело запева најлепшим гласом.

Поред својих солистичких ангажмана, Јан Фоглер стално тражи нове начине да комбинује музику са другим уметностима. У фебруару 2024. године, одржао је изузетно хваљен концерт у Ајзак Стерн Аудиторијуму у Карнеги Холу са инаугуралном песникињом Амандом Горман, изводећи савремене песме Горманове уз свите за виолончело Ј. С. Баха. Дуо се појавио у популарној емисији Late Night Show са водитељем Стивеном Колбером у марту 2024. године. Јан Фоглер је такође сарађивао са глумцем Билом Марејем на музичко-литерарном пројекту Бил Мареј, Јан Фоглер и пријатељи – нови светови. Иновативни програм овог пројекта привукао је међународну пажњу и спојио дела Твена, Хемингвеја, Витмана, Купера, Бернштајна, Баха, Пјацоле, Мансинија, Гершвина и Фостера у неочекиваном и узбудљивом истраживању односа између литературе и музике.

Истакнути ангажмани у солистичкој каријери Јана Фоглера укључују концерте са Њујоршком филхармонијом – како у Њујорку, тако и у Дрездену, поводом поновног отварања обновљене Цркве наше Госпе у Дрездену под диригентском палицом Лорина Мазела 2005. године – као и са Симфонијским оркестрима из Чикага, Бостона, Питсбурга и Монтреала, оркестром Sächsische Staatskapelle из Дрездена, Симфонијским оркестром из Бирмингема, Оркестром Академија Св. Ћећилије из Рима, Бечким симфонијским оркестром, Минхенском филхармонијом, као и са ансамблом Витезови. Сарађивао је са диригентима као што су Андрис Нелсонс, Фабио Луизи, Сер Антонио Папано, Валериј Гергијев, Томас Хенгелброк, Манфред Хонецк и Кент Нагано.

Под уметничким вођством Јана Фоглера и диригента Кента Нагана, Вагнерова тетралогија Прстен Нибелунга ће бити изведена у уметничком контексту периода у којем је компонована, према најновијим истраживањима о Вагнеру и историјски информисаној извођачкој пракси. Ово извођење биће интегрисано у опсежан пратећи програм као део вишегодишњег пројекта Вагнерови циклуси Дрезденског музичког фестивала од 2023. до 2026. године. Увод у овај програм је било извођење Рајнског злата на Дрезденском музичком фестивалу 2023. године и турнеја у Келну, Равелу и Луцерну под вођством Кента Нагана. Извођење опере Валкира као другог дела овог епског наратива, предстоји у 2024. години.

Јан Фоглер успешно сарађује са издавачком кућом Сони Класикал од 2003. године и у оквиру те сарадње је до сада снимљено и објављено око 20 ЦД-ова. Најновија издања укључују Концерте за виолончело Едварда Лалоа и Енрикеа Казалса из марта 2023. године, затим албум Дворжак који је с фокусом на дела овог композитора, снимљен заједно са музичарима окупљеним на Морицбуршком фестивалу и објављен у јулу 2022. године. На албуму Поп песме објављеном у мају 2022. године, Јан Фоглер заједно са Омером Мајр Велбером и Симфонијским оркестром Би-Би-Си-ја истражује историју жанра поп песме кроз протекле векове. У јуну 2020. године, објављен је његов снимак концерта за виолончело Три континента, који су посебно за њега компоновали Нико Мјули (САД), Свен Хелбиг (Немачка) и Жу Лонг (Кина). Ово издање Фоглер је снимио заједно са Симфонијским оркестром Радија Западне Немачке под диригентском палицом Кристијана Мачелара, а на њему се такође налази и снимак Шостаковичевог Концерта за виолончело бр. 2 са оркестром Марински под диригентском палицом Валерија Гергијева.

Ранији снимци укључују двоструке концерте за виолину и виолончело Рима, Брамса и Харбисона, заједно са виолинисткињом Миром Ванг, Краљевским шкотским националним оркестром и диригентом Питером Оунџијаном (мај 2018), као и Шуманов Концерт за виолончело заједно са оркестром Музичког фестивала у Дрездену и Ивом Болтоном (октобар 2016), Рококо варијације Чајковског, са Симфонијским оркестром Франкфуртског радија, под диригентском палицом Андреса Ороско-Естраде и ансамблом Морицбуршког фестивала (март 2016), затим Концерти из Венеције са барокним оркестром La Folia који садржи венецијанске концерте за виолончело из 18. века Вивалдија, Калдаре, Порпоре и других, потом албум Шумановог циклуса Песникова љубав са Елен Гримо и другима, као и његов веома хваљен снимак Бахових Шест свита за соло виолончело. Након успеха његовог ЦД-а Моје мелодије са кратким карактерним комадима, објављен је и други део овог издања. Уследио је награђивани снимак Дворжаковог Концерта за виолончело са Њујоршком филхармонијом под вођством Дејвида Робертсона (награде Pizzicato Supersonic, Diapason d’Or Janvier, Choc – Le Monde de la Musique Mars).

Јан Фоглер је од октобра 2008. године интендант реномираног Музичког фестивала у Дрездену, као и уметнички директор Морицбуршког фестивала од 2001. године. Године 2017, Морицбуршки фестивал је прославио 25 година постојања као један од најпризнатијих међународних фестивала камерне музике.

Године 2006, Јан Фоглер је добио Европску награду за културу, а 2011. године и Ерих-Кестнер награду за толеранцију, хуманост и међународно разумевање. У јуну 2018, као директору Музичког фестивала у Дрездену додељена му је Европска награда за културу ТАУРУС. Године 2021, Јан Фоглер је одликован Орденом заслуга Савезне Републике Немачке.

Јан Фоглер свира на Страдиваријевом виолончелу Екс Кастелбарко/Фау из 1707. године.